Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CratP47934 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CratP47934 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CratP47934 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CratP47934 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CratP47934 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CratP47934 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CratP47934 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CratP47934 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CratP47934 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CratP47934 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CratP47934 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CratP47934 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CratP47934 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CratP47934 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CratP47934 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CratP47934 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CratP47934 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CratP47934 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CratP47934 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CratP47934 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CratP47934 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CratP47934 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CratP47934 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CratP47934 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CratP47934 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CratP47934 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CratP47934 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CratP47934 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CratP47934 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CratP47934 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CratP47934 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CratP47934 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CratP47934 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CratP47934 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CratP47934 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CratP47934 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CratP47934 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CratP47934 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CratP47934 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CratP47934 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CratP47934 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CratP47934 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CratP47934 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CratP47934 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CratP47934 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CratP47934 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CratP47934 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CratP47934 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CratP47934 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CratP47934 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CratP47934 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CratP47934 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CratP47934 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CratP47934 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CratP47934 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CratP47934 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CratP47934 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CratP47934 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CratP47934 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CratP47934 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CratP47934 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CratP47934 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CratP47934 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CratP47934 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CratP47934 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CratP47934 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CratP47934 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CratP47934 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CratP47934 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CratP47934 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CratP47934 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CratP47934 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CratP47934 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CratP47934 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CratP47934 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CratP47934 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CratP47934 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CratP47934 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CratP47934 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CratP47934 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CratP47934 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CratP47934 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CratP47934 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CratP47934 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CratP47934 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CratP47934 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CratP47934 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CratP47934 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CratP47934 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CratP47934 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CratP47934 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms