Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pax9P47242 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax9P47242 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax9P47242 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pax9P47242 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax9P47242 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax9P47242 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax9P47242 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pax9P47242 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pax9P47242 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms