Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf1P46099 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf1P46099 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf1P46099 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf1P46099 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klf1P46099 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf1P46099 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf1P46099 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf1P46099 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf1P46099 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf1P46099 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms