Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5cP41230 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5cP41230 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5cP41230 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5cP41230 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms