Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5cP41230 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5cP41230 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5cP41230 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5cP41230 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5cP41230 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm5cP41230 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5cP41230 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Kdm5cP41230 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm5cP41230 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5cP41230 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5cP41230 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms