Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VhlP40338 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VhlP40338 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VhlP40338 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VhlP40338 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VhlP40338 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VhlP40338 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VhlP40338 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VhlP40338 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VhlP40338 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VhlP40338 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VhlP40338 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VhlP40338 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VhlP40338 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VhlP40338 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VhlP40338 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VhlP40338 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VhlP40338 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VhlP40338 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VhlP40338 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VhlP40338 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VhlP40338 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VhlP40338 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VhlP40338 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VhlP40338 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VhlP40338 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VhlP40338 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VhlP40338 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VhlP40338 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VhlP40338 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VhlP40338 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VhlP40338 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VhlP40338 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VhlP40338 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VhlP40338 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VhlP40338 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VhlP40338 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VhlP40338 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VhlP40338 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VhlP40338 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VhlP40338 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VhlP40338 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VhlP40338 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VhlP40338 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VhlP40338 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VhlP40338 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VhlP40338 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VhlP40338 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VhlP40338 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VhlP40338 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VhlP40338 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VhlP40338 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VhlP40338 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VhlP40338 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VhlP40338 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VhlP40338 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VhlP40338 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VhlP40338 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VhlP40338 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VhlP40338 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VhlP40338 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VhlP40338 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VhlP40338 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VhlP40338 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VhlP40338 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VhlP40338 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VhlP40338 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VhlP40338 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VhlP40338 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VhlP40338 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VhlP40338 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VhlP40338 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VhlP40338 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VhlP40338 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VhlP40338 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VhlP40338 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VhlP40338 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VhlP40338 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VhlP40338 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VhlP40338 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VhlP40338 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms