Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps26aP40336 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps26aP40336 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps26aP40336 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms