Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acvr1P37172 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acvr1P37172 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acvr1P37172 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acvr1P37172 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1P37172 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms