Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ly6dP35459 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ly6dP35459 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ly6dP35459 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ly6dP35459 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ly6dP35459 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms