Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn11P35235 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn11P35235 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ptpn11P35235 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn11P35235 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms