Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Stfa3P35173 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stfa3P35173 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stfa3P35173 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stfa3P35173 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms