Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa10P31310 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxa10P31310 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa10P31310 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa10P31310 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms