Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tacr1P30548 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tacr1P30548 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tacr1P30548 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms