Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ckmt1P30275 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ckmt1P30275 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms