Protein–RNA interactions for Protein: P29754

Agtr1a, Type-1A angiotensin II receptor, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agtr1aP29754 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Agtr1aP29754 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Agtr1aP29754 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Agtr1aP29754 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Agtr1aP29754 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms