Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 ELP6YMR312W 822 nt7.41□□□□□ -1.22
BRF1P29056 GYP8YFL027C 1494 nt7.41□□□□□ -1.22
BRF1P29056 MTC6YHR151C 1581 nt7.41□□□□□ -1.22
BRF1P29056 YNL295WYNL295W 1575 nt7.41□□□□□ -1.22
BRF1P29056 SKY1YMR216C 2229 nt7.4□□□□□ -1.22
BRF1P29056 DOC1YGL240W 753 nt7.4□□□□□ -1.22
BRF1P29056 FZF1YGL254W 900 nt7.4□□□□□ -1.22
BRF1P29056 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.4□□□□□ -1.22
BRF1P29056 RFS1YBR052C 633 nt7.4□□□□□ -1.22
BRF1P29056 YBR226CYBR226C 411 nt7.4□□□□□ -1.22
BRF1P29056 YLL058WYLL058W 1728 nt7.4□□□□□ -1.23
BRF1P29056 MAL31YBR298C 1845 nt7.4□□□□□ -1.23
BRF1P29056 MPA43YNL249C 1629 nt7.39□□□□□ -1.23
BRF1P29056 GNA1YFL017C 480 nt7.39□□□□□ -1.23
BRF1P29056 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.39□□□□□ -1.23
BRF1P29056 ATP23YNR020C 813 nt7.39□□□□□ -1.23
BRF1P29056 TOD6YBL054W 1578 nt7.38□□□□□ -1.23
BRF1P29056 ATF1YOR377W 1578 nt7.38□□□□□ -1.23
BRF1P29056 SRF1YDL133W 1314 nt7.38□□□□□ -1.23
BRF1P29056 PSA1YDL055C 1086 nt7.38□□□□□ -1.23
BRF1P29056 NMA2YGR010W 1188 nt7.38□□□□□ -1.23
BRF1P29056 INP54YOL065C 1155 nt7.38□□□□□ -1.23
BRF1P29056 AOS1YPR180W 1044 nt7.38□□□□□ -1.23
BRF1P29056 TPK1YJL164C 1194 nt7.37□□□□□ -1.23
BRF1P29056 HAM1YJR069C 594 nt7.37□□□□□ -1.23
BRF1P29056 MSI1YBR195C 1269 nt7.37□□□□□ -1.23
BRF1P29056 VMA2YBR127C 1554 nt7.37□□□□□ -1.23
BRF1P29056 NSE5YML023C 1671 nt7.36□□□□□ -1.23
BRF1P29056 SEC24YIL109C 2781 nt7.36□□□□□ -1.23
BRF1P29056 HMS2YJR147W 1077 nt7.36□□□□□ -1.23
BRF1P29056 YFR006WYFR006W 1608 nt7.36□□□□□ -1.23
BRF1P29056 YGL081WYGL081W 963 nt7.35□□□□□ -1.23
BRF1P29056 YBL070CYBL070C 321 nt7.35□□□□□ -1.23
BRF1P29056 MKK1YOR231W 1527 nt7.35□□□□□ -1.23
BRF1P29056 SPS1YDR523C 1473 nt7.35□□□□□ -1.23
BRF1P29056 QCR6YFR033C 444 nt7.34□□□□□ -1.23
BRF1P29056 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.34□□□□□ -1.23
BRF1P29056 CLN1YMR199W 1641 nt7.34□□□□□ -1.24
BRF1P29056 HRB1YNL004W 1365 nt7.33□□□□□ -1.24
BRF1P29056 RSP5YER125W 2430 nt7.33□□□□□ -1.24
BRF1P29056 OSM1YJR051W 1506 nt7.33□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YHR033WYHR033W 1272 nt7.33□□□□□ -1.24
BRF1P29056 LEO1YOR123C 1395 nt7.33□□□□□ -1.24
BRF1P29056 GTS1YGL181W 1191 nt7.32□□□□□ -1.24
BRF1P29056 CDC3YLR314C 1563 nt7.32□□□□□ -1.24
BRF1P29056 RQC1YDR333C 2172 nt7.32□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YJL144WYJL144W 315 nt7.31□□□□□ -1.24
BRF1P29056 SNF7YLR025W 723 nt7.31□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YOX1YML027W 1158 nt7.31□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YOR111WYOR111W 699 nt7.31□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YPT10YBR264C 600 nt7.31□□□□□ -1.24
BRF1P29056 UME1YPL139C 1383 nt7.31□□□□□ -1.24
BRF1P29056 POX1YGL205W 2247 nt7.31□□□□□ -1.24
BRF1P29056 GET2YER083C 858 nt7.3□□□□□ -1.24
BRF1P29056 SNA3YJL151C 402 nt7.3□□□□□ -1.24
BRF1P29056 PTH2YBL057C 627 nt7.3□□□□□ -1.24
BRF1P29056 CDC16YKL022C 2523 nt7.3□□□□□ -1.24
BRF1P29056 DCR2YLR361C 1737 nt7.3□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YBL113CYBL113C 2379 nt7.29□□□□□ -1.24
BRF1P29056 PET10YKR046C 852 nt7.29□□□□□ -1.24
BRF1P29056 DSC3YOR223W 879 nt7.29□□□□□ -1.24
BRF1P29056 CDC23YHR166C 1881 nt7.29□□□□□ -1.24
BRF1P29056 PRY2YKR013W 990 nt7.28□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YNL017CYNL017C 339 nt7.28□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YPQ1YOL092W 927 nt7.28□□□□□ -1.24
BRF1P29056 YPC1YBR183W 951 nt7.28□□□□□ -1.24
BRF1P29056 RTC2YBR147W 891 nt7.27□□□□□ -1.25
BRF1P29056 NOG2YNR053C 1461 nt7.27□□□□□ -1.25
BRF1P29056 SKP1YDR328C 585 nt7.26□□□□□ -1.25
BRF1P29056 PIL1YGR086C 1020 nt7.26□□□□□ -1.25
BRF1P29056 CYS3YAL012W 1185 nt7.26□□□□□ -1.25
BRF1P29056 DAL80YKR034W 810 nt7.26□□□□□ -1.25
BRF1P29056 YPL067CYPL067C 597 nt7.26□□□□□ -1.25
BRF1P29056 TCB1YOR086C 3561 nt7.25□□□□□ -1.25
BRF1P29056 TKL2YBR117C 2046 nt7.25□□□□□ -1.25
BRF1P29056 TPI1YDR050C 747 nt7.25□□□□□ -1.25
BRF1P29056 SRY1YKL218C 981 nt7.25□□□□□ -1.25
BRF1P29056 ERV25YML012W 636 nt7.25□□□□□ -1.25
BRF1P29056 CAN1YEL063C 1773 nt7.25□□□□□ -1.25
BRF1P29056 RMD8YFR048W 1989 nt7.24□□□□□ -1.25
BRF1P29056 YDR215CYDR215C 414 nt7.24□□□□□ -1.25
BRF1P29056 ERP2YAL007C 648 nt7.24□□□□□ -1.25
BRF1P29056 RRN10YBL025W 438 nt7.24□□□□□ -1.25
BRF1P29056 AAD14YNL331C 1131 nt7.24□□□□□ -1.25
BRF1P29056 GDA1YEL042W 1557 nt7.24□□□□□ -1.25
BRF1P29056 SPG1YGR236C 288 nt7.23□□□□□ -1.25
BRF1P29056 MBF1YOR298C-A 456 nt7.23□□□□□ -1.25
BRF1P29056 CST26YBR042C 1194 nt7.23□□□□□ -1.25
BRF1P29056 HXT15YDL245C 1704 nt7.22□□□□□ -1.25
BRF1P29056 HXT16YJR158W 1704 nt7.22□□□□□ -1.25
BRF1P29056 OPI1YHL020C 1215 nt7.22□□□□□ -1.25
BRF1P29056 TRR2YHR106W 1029 nt7.22□□□□□ -1.25
BRF1P29056 FRE5YOR384W 2085 nt7.21□□□□□ -1.25
BRF1P29056 BDS1YOL164W 1941 nt7.21□□□□□ -1.25
BRF1P29056 RRP46YGR095C 672 nt7.21□□□□□ -1.26
BRF1P29056 POR2YIL114C 846 nt7.21□□□□□ -1.26
BRF1P29056 CAR2YLR438W 1275 nt7.21□□□□□ -1.26
BRF1P29056 SEC23YPR181C 2307 nt7.21□□□□□ -1.26
BRF1P29056 YBR284WYBR284W 2394 nt7.2□□□□□ -1.26
BRF1P29056 HNM1YGL077C 1692 nt7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 90.1 ms