Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bmi1P25916 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bmi1P25916 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bmi1P25916 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bmi1P25916 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bmi1P25916 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bmi1P25916 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bmi1P25916 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bmi1P25916 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bmi1P25916 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms