Protein–RNA interactions for Protein: P22389

Edn2, Endothelin-2, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn2P22389 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn2P22389 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn2P22389 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn2P22389 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn2P22389 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn2P22389 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn2P22389 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn2P22389 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn2P22389 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn2P22389 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn2P22389 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn2P22389 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn2P22389 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms