Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klra1P20937 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klra1P20937 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klra1P20937 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klra1P20937 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klra1P20937 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klra1P20937 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klra1P20937 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klra1P20937 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klra1P20937 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klra1P20937 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Klra1P20937 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klra1P20937 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klra1P20937 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klra1P20937 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms