Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfeP19426 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfeP19426 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NelfeP19426 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfeP19426 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfeP19426 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfeP19426 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfeP19426 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfeP19426 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfeP19426 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms