Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sdc1P18828 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sdc1P18828 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sdc1P18828 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sdc1P18828 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sdc1P18828 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sdc1P18828 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms