Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata1P17679 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata1P17679 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata1P17679 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata1P17679 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata1P17679 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata1P17679 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata1P17679 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata1P17679 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata1P17679 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms