Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctla2bP12400 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctla2bP12400 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms