Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp1P12032 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp1P12032 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Timp1P12032 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Timp1P12032 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timp1P12032 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timp1P12032 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timp1P12032 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timp1P12032 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timp1P12032 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timp1P12032 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Timp1P12032 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Timp1P12032 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Timp1P12032 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timp1P12032 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timp1P12032 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timp1P12032 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms