Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa1P11477 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa1P11477 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa1P11477 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa1P11477 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa1P11477 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa1P11477 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms