Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd4P10628 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd4P10628 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4P10628 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms