Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufb1P0DN34 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ndufb1P0DN34 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ndufb1P0DN34 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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