Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbk3P0C5K0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbk3P0C5K0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbk3P0C5K0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbk3P0C5K0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbk3P0C5K0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbk3P0C5K0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbk3P0C5K0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk3P0C5K0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Sbk3P0C5K0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms