Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb8P09632 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb8P09632 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxb8P09632 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb8P09632 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms