Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp1P08042 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp1P08042 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp1P08042 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms