Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01823 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01823 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01823 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01823 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01823 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01823 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01823 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01823 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01823 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01823 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01823 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01823 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01823 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01823 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01823 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01823 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01823 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01823 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01823 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01823 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01823 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01823 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01823 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01823 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01823 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01823 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01823 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01823 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01823 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01823 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01823 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01823 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01823 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01823 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01823 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01823 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01823 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01823 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01823 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01823 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01823 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01823 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01823 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01823 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01823 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01823 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01823 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01823 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01823 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01823 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01823 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01823 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01823 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01823 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01823 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01823 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01823 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01823 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01823 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01823 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01823 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01823 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01823 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01823 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01823 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01823 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01823 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01823 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01823 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01823 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01823 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms