Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01793 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01793 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01793 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
P01793 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
P01793 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01793 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01793 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01793 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01793 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01793 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01793 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01793 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01793 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P01793 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P01793 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01793 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01793 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01793 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01793 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01793 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01793 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01793 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01793 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01793 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01793 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01793 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01793 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01793 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01793 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01793 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01793 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01793 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01793 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01793 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01793 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01793 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01793 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01793 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01793 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01793 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01793 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01793 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01793 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01793 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01793 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01793 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01793 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01793 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01793 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01793 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01793 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01793 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01793 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01793 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01793 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01793 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01793 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01793 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01793 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01793 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01793 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01793 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01793 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01793 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01793 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01793 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01793 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01793 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01793 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01793 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01793 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01793 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01793 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01793 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01793 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01793 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01793 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01793 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01793 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01793 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01793 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms