Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01747 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01747 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01747 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01747 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01747 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01747 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01747 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01747 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01747 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01747 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01747 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01747 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01747 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01747 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01747 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01747 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01747 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01747 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01747 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01747 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01747 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01747 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01747 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01747 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01747 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01747 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01747 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01747 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01747 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01747 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01747 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01747 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01747 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01747 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01747 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01747 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01747 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01747 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01747 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01747 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01747 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01747 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01747 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01747 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01747 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01747 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01747 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01747 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01747 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01747 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01747 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01747 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01747 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01747 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01747 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01747 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01747 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01747 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01747 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01747 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01747 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01747 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01747 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01747 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01747 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01747 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01747 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01747 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01747 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01747 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01747 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01747 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01747 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01747 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01747 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01747 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01747 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01747 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01747 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01747 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms