Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01727 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01727 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01727 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01727 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01727 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01727 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01727 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01727 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01727 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01727 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01727 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01727 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01727 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01727 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01727 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01727 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01727 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01727 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01727 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01727 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01727 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01727 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01727 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01727 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01727 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01727 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01727 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01727 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01727 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01727 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01727 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01727 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01727 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01727 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01727 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01727 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01727 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01727 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01727 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01727 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01727 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01727 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01727 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01727 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01727 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01727 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01727 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01727 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01727 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01727 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01727 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01727 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01727 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01727 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01727 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01727 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01727 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01727 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01727 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01727 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01727 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01727 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01727 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01727 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01727 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01727 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01727 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01727 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01727 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01727 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01727 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01727 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01727 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01727 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01727 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01727 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01727 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01727 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01727 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01727 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01727 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01727 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01727 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01727 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01727 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01727 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01727 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01727 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01727 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01727 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01727 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1557.4 ms