Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01679 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01679 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01679 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01679 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01679 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01679 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01679 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01679 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01679 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01679 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01679 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01679 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01679 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01679 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01679 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01679 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01679 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01679 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01679 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
P01679 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01679 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01679 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01679 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01679 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01679 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01679 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01679 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01679 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01679 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01679 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01679 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P01679 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01679 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01679 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01679 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01679 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01679 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01679 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01679 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01679 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01679 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
P01679 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
P01679 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01679 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01679 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01679 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01679 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P01679 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01679 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01679 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01679 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01679 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01679 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01679 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01679 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01679 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01679 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
P01679 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01679 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01679 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01679 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01679 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01679 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01679 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01679 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01679 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01679 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01679 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01679 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01679 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01679 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01679 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01679 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01679 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01679 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01679 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
P01679 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01679 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01679 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01679 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01679 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01679 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01679 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01679 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01679 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01679 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01679 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01679 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01679 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01679 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01679 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01679 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01679 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01679 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01679 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01679 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01679 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01679 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01679 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms