Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01674 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01674 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01674 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01674 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01674 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01674 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01674 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01674 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01674 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01674 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01674 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01674 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01674 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01674 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01674 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01674 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01674 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01674 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01674 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01674 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01674 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01674 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01674 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01674 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01674 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01674 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01674 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01674 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01674 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01674 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01674 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01674 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01674 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01674 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01674 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01674 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01674 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01674 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01674 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01674 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01674 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01674 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01674 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01674 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01674 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01674 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01674 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01674 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01674 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01674 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01674 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01674 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01674 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01674 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01674 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01674 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01674 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01674 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01674 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01674 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01674 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01674 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01674 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01674 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01674 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01674 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01674 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms