Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01641 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01641 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01641 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01641 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01641 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
P01641 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01641 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01641 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01641 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01641 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01641 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01641 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01641 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01641 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01641 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01641 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01641 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01641 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01641 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01641 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01641 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01641 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01641 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P01641 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01641 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01641 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01641 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01641 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P01641 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01641 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P01641 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01641 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01641 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01641 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01641 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01641 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P01641 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01641 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01641 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01641 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01641 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01641 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01641 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01641 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P01641 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P01641 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01641 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01641 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01641 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01641 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01641 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01641 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01641 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
P01641 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01641 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01641 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01641 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01641 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01641 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01641 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01641 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01641 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01641 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01641 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01641 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01641 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01641 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01641 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01641 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01641 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01641 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01641 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01641 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P01641 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01641 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01641 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01641 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01641 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01641 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01641 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P01641 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01641 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01641 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01641 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01641 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01641 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01641 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01641 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01641 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01641 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01641 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01641 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms