Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Odc1P00860 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odc1P00860 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odc1P00860 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Odc1P00860 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Odc1P00860 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Odc1P00860 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Odc1P00860 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odc1P00860 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Odc1P00860 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Odc1P00860 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Odc1P00860 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Odc1P00860 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms