Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ier5O89113 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ier5O89113 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ier5O89113 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ier5O89113 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ier5O89113 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ier5O89113 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ier5O89113 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ier5O89113 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ier5O89113 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ier5O89113 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ier5O89113 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ier5O89113 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ier5O89113 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ier5O89113 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ier5O89113 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ier5O89113 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ier5O89113 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ier5O89113 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms