Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ShdO88834 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ShdO88834 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ShdO88834 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ShdO88834 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ShdO88834 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ShdO88834 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ShdO88834 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ShdO88834 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ShdO88834 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ShdO88834 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ShdO88834 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ShdO88834 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ShdO88834 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ShdO88834 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ShdO88834 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ShdO88834 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ShdO88834 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ShdO88834 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ShdO88834 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ShdO88834 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ShdO88834 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ShdO88834 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ShdO88834 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ShdO88834 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ShdO88834 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ShdO88834 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ShdO88834 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ShdO88834 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ShdO88834 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ShdO88834 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ShdO88834 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ShdO88834 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ShdO88834 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ShdO88834 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ShdO88834 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ShdO88834 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ShdO88834 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ShdO88834 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ShdO88834 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ShdO88834 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ShdO88834 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ShdO88834 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ShdO88834 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ShdO88834 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ShdO88834 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ShdO88834 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ShdO88834 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ShdO88834 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ShdO88834 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ShdO88834 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ShdO88834 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ShdO88834 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ShdO88834 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShdO88834 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShdO88834 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShdO88834 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShdO88834 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ShdO88834 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShdO88834 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShdO88834 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShdO88834 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ShdO88834 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ShdO88834 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ShdO88834 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ShdO88834 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ShdO88834 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ShdO88834 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ShdO88834 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ShdO88834 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ShdO88834 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ShdO88834 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ShdO88834 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ShdO88834 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ShdO88834 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ShdO88834 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShdO88834 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShdO88834 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ShdO88834 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShdO88834 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShdO88834 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShdO88834 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShdO88834 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ShdO88834 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ShdO88834 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShdO88834 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShdO88834 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShdO88834 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShdO88834 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ShdO88834 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShdO88834 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ShdO88834 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShdO88834 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShdO88834 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ShdO88834 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShdO88834 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ShdO88834 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShdO88834 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ShdO88834 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShdO88834 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.2 ms