Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F11rO88792 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F11rO88792 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F11rO88792 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F11rO88792 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F11rO88792 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F11rO88792 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F11rO88792 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F11rO88792 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F11rO88792 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F11rO88792 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F11rO88792 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F11rO88792 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F11rO88792 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F11rO88792 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F11rO88792 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F11rO88792 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F11rO88792 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F11rO88792 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F11rO88792 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F11rO88792 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F11rO88792 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F11rO88792 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F11rO88792 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
F11rO88792 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F11rO88792 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F11rO88792 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F11rO88792 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
F11rO88792 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F11rO88792 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F11rO88792 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F11rO88792 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F11rO88792 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F11rO88792 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F11rO88792 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F11rO88792 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F11rO88792 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F11rO88792 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F11rO88792 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F11rO88792 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F11rO88792 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F11rO88792 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F11rO88792 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F11rO88792 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F11rO88792 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F11rO88792 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F11rO88792 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F11rO88792 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F11rO88792 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F11rO88792 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F11rO88792 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F11rO88792 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F11rO88792 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F11rO88792 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F11rO88792 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F11rO88792 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F11rO88792 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F11rO88792 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F11rO88792 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F11rO88792 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F11rO88792 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F11rO88792 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F11rO88792 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F11rO88792 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F11rO88792 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
F11rO88792 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F11rO88792 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F11rO88792 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F11rO88792 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F11rO88792 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F11rO88792 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F11rO88792 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F11rO88792 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F11rO88792 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F11rO88792 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F11rO88792 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
F11rO88792 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
F11rO88792 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
F11rO88792 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F11rO88792 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F11rO88792 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.9 ms