Protein–RNA interactions for Protein: O70400

Pdlim1, PDZ and LIM domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim1O70400 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim1O70400 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdlim1O70400 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim1O70400 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim1O70400 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim1O70400 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdlim1O70400 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim1O70400 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdlim1O70400 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim1O70400 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdlim1O70400 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdlim1O70400 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdlim1O70400 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim1O70400 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms