Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtssO70370 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtssO70370 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtssO70370 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtssO70370 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtssO70370 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtssO70370 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtssO70370 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CtssO70370 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtssO70370 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtssO70370 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtssO70370 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtssO70370 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtssO70370 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtssO70370 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtssO70370 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtssO70370 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtssO70370 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtssO70370 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtssO70370 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtssO70370 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtssO70370 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtssO70370 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtssO70370 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtssO70370 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtssO70370 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtssO70370 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtssO70370 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtssO70370 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtssO70370 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtssO70370 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtssO70370 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtssO70370 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtssO70370 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CtssO70370 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtssO70370 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtssO70370 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtssO70370 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtssO70370 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtssO70370 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtssO70370 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtssO70370 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtssO70370 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtssO70370 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtssO70370 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtssO70370 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtssO70370 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtssO70370 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CtssO70370 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CtssO70370 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtssO70370 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtssO70370 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtssO70370 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtssO70370 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtssO70370 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtssO70370 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtssO70370 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtssO70370 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtssO70370 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtssO70370 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtssO70370 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtssO70370 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtssO70370 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtssO70370 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtssO70370 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtssO70370 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtssO70370 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CtssO70370 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtssO70370 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtssO70370 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtssO70370 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtssO70370 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtssO70370 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtssO70370 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtssO70370 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtssO70370 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtssO70370 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtssO70370 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtssO70370 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtssO70370 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtssO70370 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CtssO70370 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtssO70370 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtssO70370 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtssO70370 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtssO70370 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtssO70370 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtssO70370 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtssO70370 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtssO70370 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CtssO70370 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtssO70370 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms