Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cer1O55233 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cer1O55233 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cer1O55233 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cer1O55233 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cer1O55233 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cer1O55233 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cer1O55233 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cer1O55233 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cer1O55233 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cer1O55233 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cer1O55233 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cer1O55233 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cer1O55233 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cer1O55233 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cer1O55233 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms