Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjd2O54851 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjd2O54851 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjd2O54851 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjd2O54851 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjd2O54851 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gjd2O54851 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjd2O54851 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjd2O54851 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjd2O54851 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjd2O54851 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms