Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxO54751 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxO54751 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxO54751 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxO54751 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxO54751 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxO54751 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxO54751 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxO54751 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxO54751 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxO54751 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CrxO54751 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CrxO54751 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxO54751 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxO54751 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrxO54751 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrxO54751 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrxO54751 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrxO54751 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrxO54751 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrxO54751 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrxO54751 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrxO54751 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrxO54751 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrxO54751 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrxO54751 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrxO54751 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrxO54751 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrxO54751 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CrxO54751 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CrxO54751 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CrxO54751 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CrxO54751 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CrxO54751 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CrxO54751 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CrxO54751 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CrxO54751 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CrxO54751 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CrxO54751 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CrxO54751 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CrxO54751 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CrxO54751 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxO54751 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxO54751 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxO54751 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxO54751 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxO54751 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxO54751 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxO54751 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxO54751 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxO54751 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxO54751 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxO54751 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxO54751 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxO54751 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxO54751 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxO54751 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxO54751 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxO54751 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxO54751 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxO54751 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxO54751 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxO54751 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxO54751 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxO54751 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxO54751 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxO54751 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxO54751 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CrxO54751 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CrxO54751 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxO54751 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxO54751 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxO54751 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxO54751 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxO54751 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxO54751 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms