Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gp1baO35930 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gp1baO35930 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1baO35930 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gp1baO35930 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gp1baO35930 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms