Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn6O35646 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn6O35646 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn6O35646 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn6O35646 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn6O35646 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn6O35646 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn6O35646 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn6O35646 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Capn6O35646 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms