Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcns1O35173 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcns1O35173 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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