Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EllO08856 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EllO08856 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EllO08856 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EllO08856 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EllO08856 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EllO08856 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EllO08856 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EllO08856 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EllO08856 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EllO08856 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EllO08856 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EllO08856 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EllO08856 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EllO08856 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EllO08856 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EllO08856 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EllO08856 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EllO08856 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EllO08856 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EllO08856 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EllO08856 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EllO08856 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EllO08856 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EllO08856 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EllO08856 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EllO08856 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EllO08856 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EllO08856 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EllO08856 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EllO08856 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EllO08856 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EllO08856 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EllO08856 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EllO08856 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EllO08856 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EllO08856 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EllO08856 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EllO08856 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EllO08856 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EllO08856 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EllO08856 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EllO08856 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EllO08856 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EllO08856 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EllO08856 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EllO08856 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EllO08856 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EllO08856 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EllO08856 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EllO08856 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EllO08856 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EllO08856 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EllO08856 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EllO08856 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EllO08856 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EllO08856 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EllO08856 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EllO08856 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EllO08856 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EllO08856 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EllO08856 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EllO08856 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EllO08856 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EllO08856 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EllO08856 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EllO08856 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EllO08856 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EllO08856 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EllO08856 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EllO08856 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EllO08856 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EllO08856 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EllO08856 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EllO08856 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EllO08856 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EllO08856 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EllO08856 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EllO08856 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EllO08856 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EllO08856 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EllO08856 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EllO08856 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EllO08856 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EllO08856 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EllO08856 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EllO08856 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EllO08856 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EllO08856 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EllO08856 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EllO08856 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EllO08856 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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