Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ebf3O08791 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf3O08791 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ebf3O08791 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ebf3O08791 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ebf3O08791 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ebf3O08791 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf3O08791 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms